se cree que el canelé se origina en el Couvent des Annonciades, Burdeos en el siglo 15 o 18. La palabra moderna «canelé» se origina en gascón, que se hablaba en Burdeos y una gran área del suroeste de Francia hasta el siglo XIX.
en Limoges, había un alimento llamado canole, un pan hecho con harina y yemas de huevo, que puede ser el mismo artículo que se vende en Burdeos desde el siglo XVIII bajo el nombre de canaule, también escrito canaulé o canaulet., Los artesanos conocidos como canauliers que se especializaban en hornearlos registraron una corporación (o gremio) con el Parlamento de Burdeos en 1663, que solo les permitía producir varios alimentos específicos: Pan Bendito, canaules y Retortillones. Dado que no formaban parte de la Corporación de pastelería (Guild), que tenía el monopolio de hornear con leche y azúcar o masa de mezcla, se les prohibió el uso de esos ingredientes. Los canauliers disputaron los privilegios de los pasteleros y el 3 de marzo de 1755 el Consejo de estado en Versalles gobernó para los canauliers y puso fin al monopolio de los pasteleros., Un edicto de 1767 limitó el número de tiendas canaulier autorizadas en una ciudad a ocho. Creó requisitos muy estrictos para ingresar a la profesión. Sin embargo, en 1785 había al menos 39 tiendas canaulier en Burdeos, al menos diez de las cuales estaban en el distrito (faubourg) de Saint-Seurin. La Revolución Francesa abolió todas las corporaciones, pero las listas de censos posteriores continúan mostrando tiendas de Canauliers y panaderos de «pan bendito».
en el primer cuarto del siglo XX el canelé reapareció, aunque es difícil fechar exactamente cuándo., Un chef de pastelería desconocido re-popularizó la receta antigua de canauliers. Añadió ron y vainilla a su masa. Es probable que su forma actual provenga de la similitud (en francés) de la palabra onda con la palabra «cannelure» (estriado, corrugación, estrías).
el nombre moderno «canelé» es de origen reciente. La Guía Gourmand de la France no lo menciona. Solo en 1985, después de que la popularidad de la pastelería había comenzado a explotar, se creó la Hermandad del Canelé de Burdeos (Confrérie du Canelé de Bordeaux) y se eliminó la segunda «n» de su nombre., El nombre canelé se convirtió en una marca colectiva, registrada en el Instituto Nacional de la Propiedad Industrial de Francia por la Hermandad. Diez años después del registro de la marca, había al menos 800 fabricantes en Aquitania y 600 en Gironda. En 1992, solo Gironda consumió unos 4,5 millones de canelés.