ArticleExon Definition Facilita il controllo affidabile dello splicing alternativo nel Proto-Oncogene RON

Lo splicing alternativo è un passo chiave nell’espressione genica eucariotica che consente la produzione di isoforme multiple di trascrizione e proteine dallo stesso gene. Anche se lo splicing è perturbato in molte malattie, attualmente mancano informazioni sui meccanismi normativi che promuovono la sua precisione ed efficienza., Analizziamo i dati di mutagenesi ad alto throughput ottenuti per un esone impiombato alternativamente nel proto-oncogene RON e determiniamo le unità funzionali che controllano questo evento di splicing. Usando la modellazione matematica di meccanismi di splicing distinti, mostriamo che lo splicing alternativo si basa in RON su un cosiddetto meccanismo di “definizione di esone”. Qui, il riconoscimento degli esoni adiacenti da parte della spliceosoma è richiesto per la rimozione di un introne., Utilizziamo il nostro modello per analizzare le differenze tra gli scenari di definizione di esone e introne e scoprire che la definizione di esone impedisce l’accumulo di prodotti di ritenzione deleteri e parzialmente giuntati durante la regolazione di splicing alternativa. Inoltre, modularizza il controllo dello splicing, poiché più ingressi regolatori sono integrati in un ingresso netto comune, indipendentemente dalla posizione e dalla natura dei corrispondenti elementi regolatori cis nell’RNA pre-messaggero. La nostra analisi suggerisce che la definizione di exon promuove risultati di splicing robusti e affidabili nello splicing RON.

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