Agente indio y oficial militar de los Estados Unidos

en 1853, Carson asumió un nuevo papel, accediendo a servir como Agente indio federal para el norte de nuevo méxico, trabajando principalmente con los Utes y los Apaches Jicarilla. Vio el impacto de la migración occidental de los colonos blancos en los Nativos Americanos, y creía que los ataques contra los blancos por parte de los Nativos Americanos se cometían en la desesperación. Para evitar que estas personas se extinguieran, Carson abogó por la creación de reservas indias.,

con el estallido de la Guerra Civil en 1861, la Unión recurrió a Carson para ayudar a organizar el Primer Regimiento de Infantería de Voluntarios de Nuevo México. Sirviendo como teniente coronel, estuvo involucrado en el sangriento enfrentamiento con soldados confederados en la Batalla de Valverde en 1862.

Carson también lideró campañas contra las tribus nativas americanas en la región, lo más infamante fue el esfuerzo para obligar a los Navajo a reubicarse en la Reserva Bosque Redondo en Fort Sumner., Carson y sus hombres destruyeron cultivos y mataron ganado, su ataque allanando el camino para que las tribus enemigas tradicionales de los Navajo siguieran con sus propios ataques. Hambrientos y exhaustos, los Navajo finalmente se rindieron en 1864, y se vieron obligados a marchar unas 300 millas hacia la reserva. El viaje, conocido como la larga caminata, resultó ser brutal, costando la vida de cientos de participantes.

últimos años en Colorado, muerte y legado

ascendido a general de brigada en 1865, Carson se trasladó a Colorado después de la guerra y fue nombrado comandante de Fort Garland., Negoció un tratado de paz con los Utes durante este tiempo antes de renunciar en 1867 debido a la disminución de la salud.

Carson pasó sus últimos meses como Superintendente de Asuntos Indios para el territorio de Colorado. Después de un agotador viaje a la Costa Este En 1868, regresó a Colorado en terribles condiciones. Después de que su tercera y última esposa muriera en abril, Carson le siguió aproximadamente un mes más tarde, el 23 de mayo de 1868, pronunciando las últimas palabras, «Doctor, compadre, adios!,»

un icono de los días de frontiersman del Oeste Americano, Carson es recordado a través de la designación de lugares como Carson City, Nevada, y Carson Pass en California. Junto con las novelas de dime que reforzaron su leyenda mientras aún estaba vivo, fue recordado en películas de temática occidental y programas de televisión como las aventuras de Kit Carson, que se emitió de 1951 a 1955.

La vida de Carson fue reexaminada en el libro de 2006 Blood and Thunder: An Epic of the American West, Por Hampton Sides. A principios de 2018, apareció en la serie documental Frontiersmen de History Channel.