Croci più complicate possono essere fatte osservando due o più geni. Il quadrato di Punnett funziona, tuttavia, solo se i geni sono indipendenti l’uno dall’altro, il che significa che avere un particolare allele del gene “A” non altera la probabilità di possedere un allele del gene “B”. Ciò equivale ad affermare che i geni non sono collegati, in modo che i due geni non tendono a ordinare insieme durante la meiosi.
Il seguente esempio illustra un incrocio diibrido tra due piante di pisello a doppio eterozigote., R rappresenta l’allele dominante per la forma (rotondo), mentre r rappresenta l’allele recessivo (rugoso). A rappresenta l’allele dominante per il colore (giallo), mentre a rappresenta l’allele recessivo (verde). Se ogni pianta ha il genotipo RrAa, e poiché gli alleli per i geni di forma e colore sono indipendenti, allora possono produrre quattro tipi di gameti con tutte le possibili combinazioni: RA, Ra, rA e ra.,
Dal momento che tratti maschera tratti recessivi (supponendo che non epistasi), ci sono nove combinazioni che hanno il fenotipo giallo, tre rotonde verde, tre che sono rugosa di colore giallo, e uno che è rugosa, di colore verde., Il rapporto 9: 3: 3: 1 è il risultato atteso quando si incrociano due genitori doppio-eterozigoti con geni non collegati. Qualsiasi altro rapporto indica che si è verificato qualcos’altro (come alleli letali, epistasi, geni collegati…ecc.;).
Metodo a riga biforcutamodifica
Il metodo a riga biforcuta (noto anche come metodo ad albero e sistema di ramificazione) può anche risolvere incroci diibridi e multibridi. Un problema viene convertito in una serie di croci monoibride e i risultati vengono combinati in un albero. Tuttavia, un albero produce lo stesso risultato di un quadrato Punnett in meno tempo e con più chiarezza., L’esempio seguente valuta un’altra croce a doppio eterozigote usando RrYy x RrYy. Come detto sopra, il rapporto fenotipico dovrebbe essere 9: 3: 3: 1 se si incrociano geni non collegati da due doppi eterozigoti. Il rapporto genotipico è stato ottenuto nel diagramma qui sotto, questo diagramma avrà più rami che se solo analizzando per il rapporto fenotipico.