bajo una nueva Constitución promulgada en marzo de 1981, Pinochet iba a seguir siendo presidente por un período de ocho años hasta 1989, cuando un referéndum nacional determinaría si servía un período adicional de ocho años. Durante la década de 1980, las políticas de libre mercado de Pinochet fueron acreditadas con el mantenimiento de una baja tasa de inflación y una tasa aceptable de crecimiento económico a pesar de una severa recesión en 1980-83., Pinochet no permitió una oposición política significativa, pero cumplió con su obligación constitucional de celebrar el plebiscito programado, que tuvo lugar antes de lo establecido, en octubre de 1988. El resultado fue un voto » no » del 55 por ciento y un voto «sí» del 43 por ciento. Aunque rechazado por el electorado, Pinochet permaneció en el cargo hasta que elecciones libres instalaron un nuevo Presidente, El Demócrata Cristiano Patricio Aylwin, el 11 de marzo de 1990.

como comandante de las fuerzas armadas hasta 1998, Pinochet con frecuencia frustró los procesos de derechos humanos contra miembros de las fuerzas de seguridad. Después de renunciar, se convirtió en senador vitalicio, un cargo otorgado a ex presidentes bajo la Constitución de 1981. Más tarde, en 1998, mientras visitaba Londres, fue detenido por las autoridades británicas después de que España solicitara su extradición en relación con la tortura de ciudadanos españoles en Chile durante su gobierno. El caso sin precedentes suscitó controversia en todo el mundo y galvanizó a las organizaciones de Derechos Humanos en Chile., Los Estados Unidos y otros países fueron impulsados a divulgar documentos anteriormente clasificados sobre chilenos que habían «desaparecido», que fueron secuestrados y presuntamente asesinados por el régimen de Pinochet. Las revelaciones sacaron a la luz detalles de la operación Colombo, en la que más de 100 izquierdistas Chilenos desaparecieron en 1975, y la Operación Cóndor, en la que varios gobiernos militares sudamericanos coordinaron sus esfuerzos para eliminar sistemáticamente a los opositores en las décadas de 1970 y 1980., En enero de 2000 se le permitió a Pinochet regresar a casa después de que un tribunal británico dictaminara que no estaba físicamente apto para ser juzgado. Sin embargo, siguió siendo investigado por las autoridades chilenas.

Más tarde, en el año 2000, Pinochet fue despojado de su inmunidad de enjuiciamiento—de la que había disfrutado como ex presidente—y se le ordenó ser juzgado por cargos de violaciones de los derechos humanos (en Chile la inmunidad se levanta caso por caso). Sin embargo, los cargos fueron retirados en 2002, después de que la Corte Suprema de Chile confirmara un fallo que declaraba que era mentalmente incapaz de defenderse ante los tribunales., Poco después, Pinochet renunció a su cargo como senador vitalicio. Hacia fines de 2004, la Comisión Nacional sobre prisión política y tortura emitió su informe, que confirmó más de 35.000 casos de tortura ocurridos durante el régimen de Pinochet. En 2005, la Corte Suprema de Chile votó a favor de eliminar la inmunidad de Pinochet por transacciones financieras ilegales, así como por un caso relacionado con la desaparición y ejecución de al menos 119 disidentes políticos cuyos cuerpos fueron encontrados en 1975 en la vecina Argentina. Fue declarado apto para ser juzgado por esos crímenes., Sin embargo, Pinochet murió al año siguiente sin haber sido juzgado por los abusos a los derechos humanos que ocurrieron mientras estaba en el poder.